J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y C o m p a r a t i v e S t u d y o f F u n g a l D i v e r s i t y i n t h e A g r i c u l t u r a l s o i l a n d N o n - a g r i c u l t u r a l s o i l o f B h a d r a v a t h i t a l u k , S h i m o g a d i s t r i c t , K a r n a t a k a , I n d i a K e y w o r d s : A g r i c u l t u r a l s o i l , N o n - a g r i c u l t u r a l s o i l ( L e a f l i t t e r s o i l ) , F u n g i . A B S T R A C T : F u n g i p l a y a n i m p o r t a n t r o l e i n t h e m a i n t e n a n c e a n d s u r v i v a l o f t r o p i c a l f o r e s t s . I n t h e p r e s e n t s t u d y , b o t h a g r i c u l t u r a l s o i l a n d n o n - a g r i c u l t u r a l s o i l s a m p l e s w e r e s t u d i e d f o r s c r e e n i n g a n d d e t e c t i o n o f f u n g a l d i v e r s i t y i n t h e s e t w o s a m p l e s . T h r e e d i f f e r e n t m e t h o d s w e r e s u b j e c t e d f o r t h e d i v e r s i t y a n a l y s i s o f f u n g i . A m o n g a l l t h e m e t h o d s s e r i a l d i l u t i o n m e t h o d i s b e t t e r c o m p a r e d t o t h e b a i t i n g t e c h n i q u e a n d w a r c u p m e t h o d . O n e g r a m o f l e a f l i t t e r s o i l s a m p l e w a s a d d e d i n t o t h e 1 0 m l o f s t e r i l e d i s t i l l e d w a t e r a n d m i x e d w e l l . T h e n , P D A m e d i a w a s p r e p a r e d a n d p o u r e d i n t o s t e r i l e p e t r i p l a t e s a n d a l l o w e d t o s o l i d i f y . T h e s e r i a l d i l u t i o n s w e r e p r e p a r e d a n d 0 . 1 m l o f e a c h d i l u t i o n w e r e t r a n s f e r r e d t o s t e r i l e p l a t e s c o n t a i n i n g P D A m e d i a . I n n o n - a g r i c u l t u r a l s o i l , f o u r s a m p l e s w e r e s c r e e n e d f o r f u n g a l d i v e r s i t y . A t o t a l o f 1 4 f u n g a l g e n e r a w e r e r e c o r d e d i n a l l t h e f o u r s a m p l e s . I n a g r i c u l t u r a l s o i l , f o u r s a m p l e s w e r e s c r e e n e d f o r f u n g a l d i v e r s i t y . A t o t a l o f 1 2 f u n g a l g e n e r a w e r e r e c o r d e d i n a l l t h e f o u r s a m p l e s . U m b l e b y l u s a m p l e s h o w s m o r e f u g a l d i v e r s i t y t h a n K u v e m p u U n i v e r s i t y C a m p u s , L a k k a v a l l i a n d B a c k w a t e r o f B h a d r a r e s e r v o i r . I n a g r i c u l t u r a l s o i l s a m p l e , m a i z e f i e l d s h o w s m o r e f u n g a l d i v e r s i t y t h a n g r o u n d n u t f i e l d , p a d d y f i e l d a n d s u g a r c a n e f i e l d . 1 2 9 - 1 3 4 | J R B | 2 0 1 1 | V o l 1 | N o 2 © F i c u s P u b l i s h e r s . T h i s O p e n A c c e s s a r t i c l e i s g o v e r n e d b y t h e C r e a t i v e C o m m o n s A t t r i b u t i o n L i c e n s e ( h t t p : / / c r e a t i v e c o m m o n s . o r g / l i c e n s e s / b y / 2 . 0 ) , w h i c h g i v e s p e r m i s s i o n f o r u n r e s t r i c t e d u s e , n o n - c o m m e r c i a l , d i s t r i b u t i o n , a n d r e p r o d u c t i o n i n a l l m e d i u m , p r o v i d e d t h e o r i g i n a l w o r k i s p r o p e r l y c i t e d . S u b m i t Y o u r M a n u s c r i p t w w w . f i c u s p u b l i s h e r s . c o m w w w . j r e s e a r c h b i o l o g y . c o m J o u r n a l o f R e s e a r c h i n b i o l o g y A n I n t e r n a t i o n a l O p e n A c c e s s O n l i n e R e s e a r c h J o u r n a l A u t h o r s : N a v e e n k u m a r K J * , T h i p p e s w a m y B 1 , T h i r u m a l e s h B . V 1 , P r a d e e p a K 2 a n d V e n k a t e s h 2 I n s t i t u t i o n : 1 D e p t . o f P . G . S t u d i e s a n d R e s e a r c h i n M i c r o b i o l o g y , K u v e m p u U n i v e r s i t y , S h a n k a r a g h a t t a - 5 7 7 4 5 1 , S h i m o g a ( D i s t . ) , K a r n a t a k a , I n d i a . 2 D e p t . o f P . G . S t u d i e s a n d R e s e a r c h i n B i o t e c h n o l o g y , K u v e m p u U n i v e r s i t y , S h a n k a r a g h a t t a - 5 7 7 4 5 1 , S h i m o g a ( D i s t . ) , K a r n a t a k a , I n d i a . * D e p t . o f P . G . S t u d i e s a n d R e s e a r c h i n M i c r o b i o l o g y , K u v e m p u U n i v e r s i t y , S h a n k a r a g h a t t a - 5 7 7 4 5 1 , S h i m o g a ( D i s t . ) , K a r n a t a k a , I n d i a . C o r r e s p o n d i n g a u t h o r : N a v e e n k u m a r K J E m a i l : n a v e e n . l a c @ g m a i l . c o m W e b A d d r e s s : h t t p : / / j r e s e a r c h b i o l o g y . c o m / D o c u m e n t s / R A 0 0 3 2 . p d f . D a t e s : R e c e i v e d : 1 9 M a y 2 0 1 1 / A c c e p t e d : 2 6 M a y 2 0 1 1 / P u b l i s h e d : 1 7 J u n 2 0 1 1 A r t i c l e C i t a t i o n : N a v e e n k u m a r K J , T h i p p e s w a m y B , T h i r u m a l e s h B V a n d P r a d e e p K , V e n k a t e s h . C o m p a r a t i v e s t u d y o f F u n g a l D i v e r s i t y i n t h e A g r i c u l t u r a l s o i l a n d N o n - a g r i c u l t u r a l s o i l i n B h a d r a v a t h i t a l u k , S h i m o g a d i s t r i c t , K a r n a t a k a , I n d i a . J o u r n a l o f r e s e a r c h i n B i o l o g y ( 2 0 1 1 ) 2 : 1 2 9 - 1 3 4 J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y A n I n t e r n a t i o n a l O n l i n e O p e n A c c e s s P u b l i c a t i o n g r o u p O r i g i n a l R e s e a r c h p a p e r

I N T R O D U C T I O N F u n g i p l a y a n i m p o r t a n t r o l e i n t h e m a i n t e n a n c e a n d s u r v i v a l o f t r o p i c a l f o r e s t s . I n s o m e c a s e s , m i c r o b e s m a y i n f l u e n c e e c o s y s t e m p r o c e s s i n d i r e c t l y b y a l t e r i n g t h e d i v e r s i t y o f o t h e r m i c r o o r g a n i s m s . I n e c o s y s t e m c o m p a r t m e n t m o d e l s , d e a d m a t e r i a l s s t i l l a t t a c h e d t o t h e l i v i n g p l a n t s a r e d i s t i n g u i s h e d f r o m l i t t e r a s ‘ s t a n d i n g d e a d ’ ( A n u K a l i a a n d R . P . G u p t a , 2 0 0 5 ) . L i t t e r d e c o m p o s i t i o n i s r e l e v a n t t o m a n y a s p e c t s o f e c o l o g y . T r a d i t i o n a l l y , e c o l o g i s t s h a v e t a u g h t t h e c o n c e p t o f t r o p i c l e v e l s a n d f o o d c h a i n s f r o m t h e p l a n t - h e r b i v o r e - c a r n i v o r e - p a r a s i t e s e q u e n c e b u t a m a r k e d f e a t u r e o f t h e c o n t e m p o r a r y t e a c h i n g i s i t s i n c r e a s e d a w a r e n e s s o f t h e p r o d u c t i o n o f t h e p r i m a r y r e s o u r c e t h a t p a s s e s t h r o u g h t h e d e c o m p o s e r c h a n n e l . A s f a r a s p r a c t i c a l a s p e c t s a r e c o n c e r n e d , i m p r o v e m e n t i n t h e f a r m i n g p r a c t i c e s a n d o t h e r o p e r a t i o n s h a v e b r o u g h t s i g n i f i c a n t e f f e c t s o v e r t h e q u a l i t y a n d q u a n t i t y o f t h e a g r i c u l t u r a l c r o p d e b r i s . ( G o n z a l e z a n d T i m o t h y , 2 0 0 1 ) . I n t r a d i t i o n a l f a r m i n g , v i r t u a l l y t h e w h o l e o f t h e p l a n t p r o d u c t i o n w a s r e t u r n e d t o t h e s o i l . L o s s o f n i t r o g e n b y a c c e l e r a t e d m i n e r a l i z a t i o n m a y b e c o m p e n s a t e d b y a i r c r a f t a p p l i c a t i o n o f u r e a a s i s p r a c t i c e d i n s o m e c o m m e r c i a l f o r e s t s . T h u s , p r o d u c t i o n s y s t e m s t h a t s u s t a i n s o i l o r g a n i c m a t t e r l e v e l s r e d u c e t h e r a t e o f o r g a n i c m a t t e r o x i d a t i o n b y l e a v i n g c r o p r e s i d u e s o n t h e s o i l s u r f a c e s , w h i c h h e l p t o m a i n t a i n s o i l p r o d u c t i v i t y ( I a n a n d C o l i n , 2 0 0 5 ) . C r o p r e s i d u e s , g r e e n m a n u r e c r o p s a n d w e e d s a r e a d d e d t o t h e a r a b l e s o i l s b y f a r m e r s e a c h y e a r i n t h e s e a s o n . T h e s e r e s i d u e s p l a y a n i m p o r t a n t r o l e i n m a i n t a i n i n g s o i l f e r t i l i t y , a f f e c t i n g b o t h t h e p h y s i c a l s t r u c t u r e o f t h e s o i l a n d i t s n u t r i e n t s t a t u s . I n a d d i t i o n , t h e s t u d y o f c r o p r e s i d u e a n d d e c o m p o s i t i o n h a s b e e n p r o m i s i n g t o t h e b i o c o n t r o l o f p l a n t p a t h o g e n s f o u n d o n t h e c r o p d e b r i s a n d i n t h e s o i l ( M a r i e e t a l . , 2 0 0 0 ) . T h e d e c o m p o s i t i o n o f p l a n t l i t t e r c a n b e d e s c r i b e d w i t h a f e w e q u a t i o n s , w h i c h i n d i c a t e t h a t o r g a n i c m a t t e r i s u l t i m a t e l y b r o k e n d o w n t o C O 2 a n d w a t e r . D i f f e r e n t t y p e s o f m i c r o o r g a n i s m s a r e i n v o l v e d i n t h e b r e a k d o w n o f f a r m c r o p l i t t e r . M a j o r i t y o f t h e f u n g a l s p e c i e s t h a t p l a y a l a r g e p a r t i n t h e p l a n t l i t t e r d e c o m p o s i t i o n a r e s a p r o p h y t i c i n n a t u r e . O n l i t t e r d e r i v e d d i r e c t l y o r i n d i r e c t l y f r o m p l a n t s , f u n g i a r e a b l e t o g r o w w h e n e v e r t h e y p o s s e s t h e n e c e s s a r y e n z y m e s y s t e m s a n d e n v i r o n m e n t a l c o n d i t i o n s ( C h r i s t i a n e t a l . , 2 0 0 5 ; S a r i H i l l e t a l . , 2 0 0 6 ) . T h e m a i n o b j e c t i v e o f t h e p r e s e n t w o r k i s t o i n v e s t i g a t e F u n g a l d i v e r s i t y o f N o n - a g r i c u l t u r a l s o i l ( l e a f l i t t e r s o i l ) i n B h a d r a v a t h i t a l u k , S h i m o g a d i s t r i c t ; K a r n a t a k a . F u n g i p l a y a m a j o r r o l e i n f e r t i l i t y a n d p r o m o t i n g p l a n t h e a l t h . T h e p r e s e n t w o r k w a s u n d e r t a k e n w i t h t h e f o l l o w i n g o b j e c t i v e s , S c r e e n i n g a n d d e t e c t i o n o f f u n g a l d i v e r s i t y i n t h e a g r i c u l t u r a l a n d n o n - a g r i c u l t u r a l s o i l s a m p l e s i n d i f f e r e n t r e g i o n s a n d C o m p a r i s o n o f t h e d i v e r s i t y o f f u n g i f r o m l e a f l i t t e r s o i l a n d a g r i c u l t u r a l s o i l ( J o n a s s o n e t a l . , 2 0 0 5 ) . M A T E R I A L S A N D M E T H O D S S a m p l e C o l l e c t i o n L e a f l i t t e r s o i l s a m p l e w a s c o l l e c t e d f r o m d i f f e r e n t f o r e s t r e g i o n s o f B h a d r a v a t h i t a l u k , S h i m o g a d i s t r i c t , K a r n a t a k a . D u r i n g t h e m o n t h o f J a n u a r y a n d F e b r u a r y 2 0 0 8 - 2 0 1 0 . F o u r f o r e s t l e a f l i t t e r s o i l s a m p l e s w e r e c o l l e c t e d f r o m t h e d i f f e r e n t r e g i o n s o f B h a d r a v a t h i t a l u k , S h i m o g a d i s t r i c t , K a r n a t a k a ( T a b l e - 1 ) a n d a n o t h e r f o u r s a m p l e s w e r e c o l l e c t e d f r o m a g r i c u l t u r a l s o i l ( T a b l e - 2 ) . S c r e e n i n g a n d D e t e c t i o n o f F u n g i F o r s c r e e n i n g a n d d e t e c t i o n o f F u n g i , t h r e e m e t h o d s w e r e u s e d . T h e y a r e S e r i a l d i l u t i o n m e t h o d , B a i t i n g t e c h n i q u e , a n d D i r e c t s o i l p l a t i n g m e t h o d / W a r c u p s o i l p l a t e m e t h o d ( A n e j a , 2 0 0 1 ) . I s o l a t i o n o f f u n g i b y s e r i a l d i l u t i o n m e t h o d O n e g r a m o f l e a f l i t t e r s o i l s a m p l e w a s a d d e d i n t o t h e 1 0 m l o f s t e r i l e d i s t i l l e d w a t e r a n d m i x e d w e l l . T h e n , P D A m e d i a w a s p r e p a r e d a n d 1 3 0 J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y ( 2 0 1 1 ) 2 : 1 2 9 - 1 3 4 N a v e e n k u m a r e t a l . , 2 0 1 1 S l . N o . N o n - a g r i c u l t u r a l s o i l P l a c e s 1 S a m p l e - 1 K u v e m p u U n i v e r s i t y C a m p u s 2 S a m p l e - 2 U m b l e b y l u 3 S a m p l e - 3 L a k k a v a l l i 4 S a m p l e - 4 B a c k w a t e r o f B h a d r a r e s e r v o i r T a b l e : 1 N o n - a g r i c u l t u r a l s o i l s a m p l e c o l l e c t e d d u r i n g t h e y e a r 2 0 0 8 - 2 0 1 0 T a b l e : 2 A g r i c u l t u r a l s o i l s a m p l e c o l l e c t e d d u r i n g t h e y e a r 2 0 0 8 - 2 0 1 0 S l . N o . A g r i c u l t u r a l s o i l P l a c e s 1 G r o u n d n u t f i e l d K u v e m p u U n i v e r s i t y C a m p u s 2 M a i z e f i e l d U m b l e b y l u 3 P a d d y f i e l d L a k k a v a l l i 4 S u g a r c a n e f i e l d B a c k w a t e r o f B h a d r a r e s e r v o i r

p o u r e d i n t o s t e r i l e p e t r i p l a t e s a n d a l l o w e d t o s o l i d i f y . T h e s e r i a l d i l u t i o n s 1 0 - 2 , 1 0 - 4 a n d 1 0 - 6 w e r e p r e p a r e d , 0 . 1 m l o f e a c h d i l u t i o n o f 1 0 - 2 , 1 0 - 4 a n d 1 0 - 6 t o s t e r i l e p l a t e c o n t a i n i n g P D A m e d i a . P l a t e s w e r e i n c u b a t e d a t 2 8 ° C f o r 5 - 7 d a y s ( A n e j a , 2 0 0 1 ) . I s o l a t i o n o f F u n g i b y B a i t i n g t e c h n i q u e 1 0 0 g m o f l i t t e r s o i l w a s t a k e n a n d p l a c e d i n a p e t r i p l a t e . S o i l w a s a d d e d w i t h d i s t i l l e d w a t e r . T h e p o t a t o o r c a r r o t w a s c u t i n t o s m a l l p i e c e s . P i e c e s o f p o t a t o a n d c a r r o t w e r e s u r f a c e s t e r i l i z e d b y 0 . 1 % s o d i u m h y p o c h l o r i d e . S t e r i l i z e d p o t a t o p i e c e s w e r e p l a c e d o n t h e p e t r i d i s h . P l a t e s w e r e i n c u b a t e d a t 2 8 º C f o r 2 t o 3 w e e k s ( A n e j a , 2 0 0 1 ) . I s o l a t i o n o f F u n g i b y D i r e c t s o i l p l a t e m e t h o d / W a r c u p s o i l p l a t e m e t h o d L e a f l i t t e r s o i l w a s c o l l e c t e d i n s t e r i l i z e d p o l y t h e n e b a g . 0 . 1 5 g o f s o i l w a s a d d e d t o t w o s t e r i l e p l a t e s w i t h t h e h e l p o f a s t e r i l i z e d c o o l e d l o o p o r t r a n s f e r n e e d l e . 1 5 - 2 0 m l o f m e l t e d , c o o l e d ( 4 5 ° C ) s a b o u r a u d a g a r m e d i a w a s a d d e d , s u p p l e m e n t e d w i t h s t r e p t o p e n i c i l l i n a n d r o s e B e n g a l , t o e a c h s o i l i n o c u l a t e d p e t r i p l a t e . D i s p e n s e t h e s o i l p a r t i c l e s t h r o u g h o u t t h e m e d i u m b y g e n t l e r o t a t i o n o f t h e p e t r i d i s h e s a n d a l l o w e d t h e p l a t e s t o s o l i d i f y . P l a t e s w e r e i n c u b a t e d a t 2 5 ° C i n a n i n v e r t e d p o s i t i o n f o r 1 5 d a y s . F u n g a l m o r p h o l o g y w a s s t u d i e d m a c r o s c o p i c a l l y b y o b s e r v i n g c o l o n y f e a t u r e s ( c o l o u r a n d s u r f a c e s ) a n d m i c r o s c o p i c a l l y b y s t a i n i n g w i t h l a n c t o p h e n o l c o t t o n b l u e a n d o b s e r v e u n d e r c o m p o u n d m i c r o s c o p e f o r t h e c o n i d i a , c o n i d i o p h o r e s a n d a r r a n g e m e n t o f s p o r e s ( A n e j a , 2 0 0 1 ; B a r n e t t , 1 9 7 5 ; B o o t h , 1 9 7 1 ; D o m s c h a n d G a m e s , 1 9 8 0 ; S i g u r d F u n d a r , 1 9 6 1 ; S u b r a m a n i a n , 1 9 8 3 ) . R E S U L T S I n n o n - a g r i c u l t u r a l s o i l ( L e a f l i t t e r s o i l ) , f o u r s a m p l e s w e r e s c r e e n e d t h e f u n g a l d i v e r s i t y w e r e d e t e c t e d . A t o t a l o f 1 4 f u n g a l g e n e r a w e r e r e c o r d e d i n a l l t h e f o u r s a m p l e s . I n U m b l e b y l u s a m p l e ( S 2 ) i m p o r t a n t f u n g a l g e n e r a l i k e M u c o r s p . , P e n i c i l l i u m s p . , C l a d o s p o r i u m s p . , A l a t o s p o r a s p . , A s p e r g i l l u s f l a v u s , A s p e r g i l l u s n i g e r , T r i c h o d e r m a s p . , C h a e t o m i u m s p . a n d F u s a r i u m s p . w e r e r e c o r d e d . I n K u v e m p u U n i v e r s i t y C a m p u s s a m p l e ( S 1 ) i m p o r t a n t f u n g a l g e n e r a l i k e M u c o r s p . , R h z o p u s s p . , G l i o c l a d i u m s p . , V e r t i c i l l i u m s p . , A s p e r g i l l u s f l a v u s , A s p e r g i l l u s n i g e r , T r i c h o d e r m a s p . , C h a e t o m i u m s p . a n d T h a m a t e p h o r u s s p . w e r e r e c o r d e d . I n L a k k a v a l l i s a m p l e ( S 3 ) i m p o r t a n t f u n g a l g e n e r a v i z . , M u c o r s p . , P e n i c i l l i u m s p . , C l a d o s p o r i u m s p . , R h i z o p u s s p . , T r i c h o s p o r i e l l a s p . , A s p e r g i l l u s f l a v u s , A s p e r g i l l u s n i g e r , T r i c h o d e r m a s p . , T h a m a t e p h o r u s s p . , C h a e t o m i u m s p . , V e r t i c i l l i u m s p . a n d H e l m i n t h o s p o r i u m s p . w e r e r e c o r d e d . I n B a c k w a t e r o f B h a d r a r e s e r v o i r s a m p l e ( S 4 ) i m p o r t a n t f u n g a l g e n e r a l i k e M u c o r s p . , P e n i c i l l i u m s p . , A l a t o s p o r a s p . , R h i z o p u s s p . , J o u r n a l o f R e s e a r c h i n B i o l o g y ( 2 0 1 1 ) 2 : 1 2 9 - 1 3 4 1 3 1 N a v e e n k u m a r e t a l . , 2 0 1 1 S l . N o . O r g a n i s m s S e r i a l d i l u t i o n m e t h o d W a r c u p m e t h o d B a i t i n g t e c h n i q u e m e t h o d S 1 S 2 S 3 S 4 S 1 S 2 S 3 S 4 S 1 S 2 S 3 S 4 1 M u c o r s p . + + + + - - - - - - - - 2 P e n i c i l l i u m s p . + - + + - - - - - - - - 3 C l a d o s p o r i u m s p . + - + - - - - - - - - - 4 A l a t o s p o r a s p . + - - + - - - - - - - - 5 R h z o p u s s p . - + + + + + + + + + + + 6 T r i c h o s p o r i e l l a s p . - - + + - - - - - - - - 7 G l i o c l a d i u m s p . - + - + - - - - - - - - 8 V e r t i c i l l i u m s p . - + - + - - - - - - - - 9 A s p e r g i l l u s f l a v u s + + + + - - - - - - - - 1 0 A s p e r g i l l u s n i g e r + + + + + - + + - - - - 1 1 T r i c h o d e r m a s p . + - + + - - - - - - - - 1 2 T h a n a t e p h o r u s s p . - - + - - - - - - - - - 1 3 C h a e t o m i u m s p . + - + - - - - - - - - - 1 4 F u s a r i u m s p . + + - + - - - - - - - - 1 5 C o c c i d i o i t e s i m m i t i s - - - - - - - - + + - - 1 6 H a p l o b a s i d i u m s p . - - - - + - - - - - - - 1 7 H e l m i n t h o s p o r i u m s p . - - - - + - + - - - - - T a b l e : 3 F u n g a l d i v e r s i t y i n t h e n o n - a g r i c u l t u r a l s o i l s a m p l e s ( l i t t e r s o i l )